Exposer ses données

Quels sont les enjeux des entrepôts de données ? Quels sont les éléments à anticiper avant de choisir un entrepôt et d'y déposer son jeu de données ? Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les objectifs et recommandations.

DoRANum et sa vidéo "La minute - Entrepôt de données"
En moins de 3 minutes, cette courte vidéo de l'Inist-CNRS propose une introduction sur les entrepôts de données (définition et enjeux, typologie, annuaires).

CoopIST et son article "Choisir le meilleur entrepôt de données"
Mis à disposition par CoopIST, cet article de synthèse permet de comprendre les enjeux et bénéfices des entrepôts de données de recherche, les catégories d'entrepôts existants, les questions essentielles à anticiper avant tout dépôt, ainsi que les critères pour sélectionner l'entrepôt adapté à ses données et à sa discipline. 

Blog de l'Institut Pasteur, "Déposer des données dans un entrepôt, que doit-on anticiper ? L’exemple de GEO"
Cet article du blog de l'Institut Pasteur propose une synthèse de l'article "Chronique d'une soumission de données à GEO" par la biologiste Isabelle Stévant, dans lequel la chercheuse revient sur l'ensemble des étapes par lesquelles elle est passée pour déposer ses données dans l'entrepôt de référence dans sa discipline. Véritable témoignage, cet article permet de donner à l'ensemble des chercheurs "un aperçu de tout ce qui doit être anticipé avant de se lancer dans un dépôt de données".

DoRANum, "Dépôt et entrepôts - Comment et où déposer mes données ?"
Pour aller plus loin sur ces enjeux, DoRANum met à disposition de nombreuses ressources constamment réactualisées (fiches, vidéos, guides, autoévaluation...) autour des entrepôts de données de recherche.

Un ensemble de critères de sélection des entrepôts de données permet de choisir parmi les nombreuses structures existantes : type d'entrepôt, formats acceptés, attribution d'identifiant persistant et de licence, pérennité de l'infrastructure, modération des dépôts, limite de volume, possibilité d'embargo et d'accès restreint aux données... Autant de questions qu'il est essentiel de se poser lors de la sélection d'un entrepôt pour déposer son jeu de données. Les ressources sélectionnées vous permettront de prendre connaissance des critères de sélection préconisés pour choisir l'entrepôt de données adapté.
 

Comité pour la science ouverte, "Sélectionner un entrepôt thématique de confiance pour le dépôt de données : méthodologie et analyse de l’offre existante"
Dans cette note, le groupe de travail du collège Données de la recherche du Comité pour la science ouverte propose une méthodologie d'identification des entrepôts thématiques. Cette méthode énonce ainsi "des critères qualitatifs et organisationnels", constituant "le socle minimum d'informations essentielles et nécessaires pour éclairer les équipes de recherche dans leur choix de dépôt" (p. 14). Une liste des entrepôts de confiance identifiés et reconnus est également consultable. 

DoRANum, "Dépôt et entrepôts : fiche synthétique"
L'Inist-CNRS et l'Urfist Méditerranée mettent à disposition une fiche synthétique revenant sur les critères de sélection des entrepôts de données et les informations essentielles à anticiper avant de déposer ses données de recherche. 

GTSO Couperin, "Les entrepôts de données d’éditeurs commerciaux : quelle stratégie adopter ?"
Pour aller plus loin, la note de décryptage du groupe Données du Groupe de travail Science ouverte (GTSO) du consortium Couperin propose un état des lieux sur les entrepôts de données d'éditeurs commerciaux (exemples, risques encourus pour le chercheur, obligations en matière d'ouverture des données, recommandations pour choisir l'entrepôt adapté).

Plusieurs organismes et structures mettent à disposition des listes et annuaires d'entrepôts de données de recherche, permettant d'identifier l'entrepôt le plus adapté à ses besoins.

Recherche Data Gouv et sa liste des entrepôts de confiance
Recherche Data Gouv relaie les entrepôts thématiques de confiance recensés par le Collège des Données de la recherche du Comité pour la science ouverte. Évolutive et progressivement complétée par le collège des Données de la recherche, cette liste n'est cependant pas exhaustive : "ainsi, ne pas figurer dans la liste n’implique pas que l’entrepôt concerné n’est pas de confiance" comme le rappelle Recherche Data Gouv.

Cat OPIDoR - Entrepôt de données
Le catalogue collaboratif des services français dédiés à la gestion des données de recherche Cat OPIDoR met à disposition un annuaire spécialisé recensant des entrepôts de données de recherche nationaux et internationaux. A noter que "les entrepôts non portés par des structures françaises sont issus de la liste des entrepôts thématiques de confiance proposés par le Collège des Données de la recherche du Comité pour la science ouverte".

CoreTrustSeal est une organisation internationale, communautaire et non gouvernementale sans but lucratif, qui promeut "des infrastructures de données durables et fiables" grâce à une certification spécifique éponyme. La certification CoreTrustSeal évalue ainsi 16 critères "relatifs aux entrepôts de données selon plusieurs niveaux de conformité" (Cat OPIDoR).
Pour découvrir les entrepôts certifiés (Trustworthy Data Repositories), un annuaire est mis à disposition. Pour comprendre les critères de certification, les lignes directives de CoreTrustSeal sont mises à disposition (rapport CoreTrustSeal Trustworthy Digital Repositories Requirements 2026-2028).

L'annuaire multidisciplinaire Re3data (Registry of Research Data Repositories) recense plus de 2 000 entrepôts. Les entrepôts sont classés par disciplines et thématiques, parmi lesquelles les entrepôts à destination des ALL-SHS et études aréales.

Pour aller plus loin, il est également possible de consulter d'autres annuaires d'entrepôts de données, comme l'outil de recherche d'entrepôts (Datacite Repository Finder) mis à disposition par l'organisation DataCite Commons, l'annuaire DOAR (Directory of Open Access Repositories) ou encore le recensement des entrepôts de l'OAD (Open Access Directory).

Les entrepôts de données disciplinaires, reconnus par les communautés de recherche et adaptés à vos jeux de données, sont à privilégier lors de la sélection d'un entrepôt. Quels sont alors les principaux entrepôts de données disciplinaires en ALL-SHS-études aréales et comment choisir le plus adapté à votre projet ? Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les enjeux des entrepôts disciplinaires en SHS, et de découvrir plus particulièrement certains d'entre eux (Nakala, CoCoON Ortolang, Pangloss).

DoRANum et sa synthèse "Choisir un entrepôt SHS"
Conçue par Huma-Num et l'Inist-CNRS, cette synthèse (fiche et diaporama interactif) détaille les enjeux de sélection des entrepôts de données pour les disciplines des SHS, analysant plusieurs entrepôts à partir de critères sélectifs. 

Mis en place par l'infrastructure de recherche étoile (IR*) Huma-Num, l'entrepôt Nakala est le principal entrepôt de données de recherche SHS.
Plusieurs types de données peuvent être déposés (fichiers textes, son, image, vidéo) dans cet entrepôt sécurisé, qui assure plusieurs niveaux de préservation : un niveau par défaut dès lors que les données y sont déposées et enregistrées (avec garantie de description grâce aux métadonnées et d'un stockage sécurisé), et un niveau avancé dans le cadre d'un partenariat avec le Centre informatique national de l'enseignement supérieur (CINES) pour une préservation à long terme et des garanties complémentaires*. Avant tout dépôt, un compte Huma-Num (HumanID) doit être créé. Comme pour tout autre entrepôt, il est recommandé de déposer ses données sous forme de jeux de données (et non fichier par fichier). Par ailleurs, il est encouragé de solliciter la modération lors du dépôt de jeux de données : à la demande du déposant, cette évaluation de la qualité documentaire des jeux de données permet de voir attribuer un label à son jeu de données (alors en statut spécifique "Modéré", témoignant de sa qualité documentaire). Un DOI est attribué automatiquement au jeu de données déposé dans Nakala.
Nakala offre donc la possibilité de déposer, documenter et diffuser les données de recherche en sciences humaines et sociales, renforçant ainsi l'accessibilité des jeux de données et leur citabilité.

*Texte ici adapté de la présentation de l'entrepôt dans Cat OPIDoR.
 

Huma-Num et sa documentation sur l’entrepôt Nakala
Huma-Num met à disposition un guide d'utilisation exhaustif de l'entrepôt Nakala : principales caractéristiques et fonctionnalités de l'entrepôt, saisie des formulaires de dépôt et de création de collection, gestion du partage des droits sur un dépôt, etc. 

La Bulac et son guide de dépôt dans Nakala
La Bulac propose un guide de dépôt dans l'entrepôt Nakala. Sous forme d'une fiche synthétique, ce guide pratique décrit précisément les critères et enjeux liés au dépôt des fichiers et à la saisie des métadonnées. 

La Bulac et le tutoriel "Créer son compte HumanID en 5 étapes"
La Bulac met à disposition un tutoriel synthétique pour créer un compte HumanID, nécessaire avant tout dépôt dans l'entrepôt Nakala. 

Mate-SHS et le webinaire Tut@MATE "Exposer les données d’un projet de recherche avec NAKALA et NAKALA_Press"
Pour aller plus loin, ce webinaire de 2 heures organisé par Mate-SHS présente l'entrepôt de données Nakala et son module d'exposition Nakala_Press. Sont ainsi abordées les démarches nécessaires à la préparation et à la documentation des données ainsi que le fonctionnement de l'entrepôt et du module d'exposition associé. 

Parmi les entrepôts disciplinaires, certains d'entre eux sont à destination de communautés de recherche spécifiques et permettent le dépôt, la documentation et le partage de jeux de données très spécialisés. A ce titre, les linguistes et chercheurs travaillant avec des données linguistiques et orales disposent de plusieurs entrepôts disciplinaires spécialisés aux objectifs et aux fonctionnalités différents. Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les enjeux des entrepôts spécialisés pour les données orales et linguistiques, et de découvrir les spécificités des principaux entrepôts (CoCoON, Ortolang Pangloss).

Inalco, Huma-Num, Inist-CNRS et leur parcours d'autoformation sur la diffusion des données de recherche en linguistique
Conçu par l'Inalco, Huma-Num et l'Inist-CNRS, ce parcours pédagogique d'01h30 permet d'appréhender les enjeux de diffusion spécifiques aux données de recherche en linguistique. Sont ainsi abordés les questionnements autour de l’ouverture des données, l'importance du tri "des données diffusables de celles non diffusables" et de la sélection des données à déposer, le choix d'un entrepôt de données en linguistique adapté à son projet et à ses besoins, et enfin la préparation concrète des données pour les déposer.

L'entrepôt CoCoON
Conçue pour les données orales, la plateforme CoCoON (Collections de Corpus Oraux Numériques) permet de déposer des enregistrements audios et vidéos (avec la possibilité de les accompagner d'annotations textuelles : transcriptions, traductions, time-code, descriptions, mesures physiologiques), issus de recherches sur les langues ou d'enquêtes. CoCoOn est hébergée par Huma-Num et gérée par le Laboratoire de Langues et Civilisations à Tradition Orale (UMR7107 LACITO) et le Laboratoire Ligérien de Linguistique (UMR7270 LLL).

Texte adapté de la fiche de Cat OPIDoR 

L'entrepôt Ortolang
Certifié CoreTrustSeal, l'entrepôt Ortolang est spécialisé dans la collecte et le dépôt des données linguistiques, plus particulièrement "les ressources et outils sur la langue écrite et orale" (*). Différentes modalités de diffusion des données sont mises à disposition dans Ortolang (diffusion en accès libre, en accès restreint ou sous embargo). Il est nécessaire de créer un compte personnel pour déposer des données.

(*) Citation extraite du parcours d'autoformation sur la diffusion des données de recherche en linguistique (Inalco, Huma-Num, Inist-CNRS). 

L'entrepôt Pangloss
Listée parmi les entrepôts de données thématiques de confiance du Groupe Données de la recherche du Comité pour la science ouverte, la collection Pangloss permet de déposer des "documents linguistiques sonores, avec une spécialité de langues rares ou peu étudiées". Pangloss se définit comme une "archive ouverte de langues en danger ou peu documentées", dans laquelle les linguistes et ethnologues peuvent ainsi déposer "les enregistrements de leurs enquêtes de terrain" (audio ou vidéo). Pangloss est hébergé par CoCoON et est à destination des personnes rattachées à une unité de recherche (ou associées par le biais d'un projet de recherche). 
La plateforme met à disposition un guide de dépôt synthétique (autorisation et accès, métadonnées, contacts, etc).

"Écosystème national dédié à la gestion, au partage et à l'ouverture des données de la recherche française", l'entrepôt national pluridisciplinaire Recherche Data Gouv permet de déposer, documenter et partager les jeux de données dans une plateforme sécurisée lorsqu'aucun entrepôt disciplinaire ou institutionnel ne correspond à vos besoins. L'entrepôt Recherche Data Gouv est constitué d' "espaces institutionnels de publication et de signalement de données des établissements qui souhaitent participer"*, ainsi que d'un espace générique pour les déposants qui ne disposent d'aucun autre espace institutionnel.
Avant tout dépôt dans l'espace générique Recherche Data Gouv, il est essentiel de vérifier que votre communauté de recherche ne dispose d'aucun entrepôt thématique reconnu et que votre établissement ne propose aucun espace institutionnel. Le logigramme « Où publier vos données ? » de Recherche Data Gouv permet de définir le type d’entrepôt à privilégier selon votre discipline, votre projet de recherche et vos données. Certains établissements de Sorbonne Alliance disposent d'un espace institutionnel Recherche Data Gouv : l'université Paris 1 Panthéon-Sorbonne et l'université Sorbonne Nouvelle (lien communiqué ultérieurement).
Tout dépôt dans l'entrepôt Recherche Data Gouv fait l'objet d'une curation, permettant de vérifier la conformité et la complétude de la documentation des jeux de données. Plusieurs modalités de diffusion et d'accès aux données sont possibles (accès ouvert, accès restreint, embargo). Un DOI est attribué automatiquement au jeu de données.

*Cette citation est issue de la synthèse sur les entrepôts de données en SHS disponible dans DoRANum. Le texte est partiellement adapté de celle-ci.
 

Développé par l'Inalco en partenariat avec la Région Ile-de-France, l'Ina et l'université Paris Cité, le portail LaCAS Data est une "base de connaissance et de documents multimédias dédiée à la recherche et la formation sur les aires géopolitiques, culturelles et linguistiques du monde". Considérée comme "une plateforme de référence des études aréales en France" (*), LaCAS Data se compose de quatre rubriques thématiques. La rubrique "Fonds documentaire" offre l'accès aux "données multimodales (textuelles, visuelles, audiovisuelles, sonores, 3D, ...) documentant la recherche (et l'enseignement) sur les aires culturelles et linguistiques du monde". 
Ces données sont majoritairement produites par les chercheurs des équipes de recherche sous la direction de l'Inalco (en tutelle ou co-tutelle avec d'autres institutions). Les autres données sont issues d'archives de chercheurs ou de programmes spécifiques (par exemple "Archives Audiovisuelles de la recherche"). 
Les autres rubriques de LaCAS Data sont complémentaires au "Fonds documentaire" : la rubrique "Collections" centralise des supports documentaires, la rubrique "Recherche" propose une cartographie des équipes et projets de recherche de l'Inalco, tandis que la rubrique "Domaine de connaissances" met à disposition un thésaurus thématique.

(*) Citation extraite de la présentation de LaCAS sur le site de l'Inalco. 

Certains partenaires des établissements de Sorbonne Alliance disposent d'autres entrepôts institutionnels, par exemple Sciences Po, l'EHESS, ou encore l'IRD. Les chercheurs affiliés à ces établissements ont alors la possibilité de déposer les jeux de données dans leurs entrepôts institutionnels lorsqu'aucun entrepôt disciplinaire et thématique ne répond à leurs besoins.
 

La Collection Sciences Po de data.sciencespo
L'entrepôt institutionnel de Sciences Po permet "d'accueillir les données produites par les chercheurs affiliés à Sciences Po, sur le principe d’auto-dépôt" (guide p.3). Plusieurs modalités de diffusion peuvent être mises en œuvre (accès fermé, sur demande ou ouvert). Un DOI est attribué automatiquement au jeu de données publié.

Didoména, l'entrepôt institutionnel de l'EHESS
A destination des sciences humaines et sociales, Didoména est l'entrepôt de données de recherche institutionnel de l'EHESS. Didoména permet de "déposer les données collectées, produites et traitées dans le cadre des travaux des unités de recherche". Plusieurs modalités de diffusion peuvent être mises en œuvre (accès restreint, accès ouvert). Les "membres statutaires et associés, doctorants et post-doctorants des unités de recherche dont l'EHESS est co-tutelle” peuvent déposer leurs données dans l'entrepôt Didoména (citation extraite du guide de l'EHESS). Il est possible d'inviter des collaborateurs externes à l'EHESS. Il est nécessaire d'être connecté avec les identifiants EHESS pour déposer les données. Un DOI est attribué automatiquement au jeu de données.

DataSuds, l'entrepôt institutionnel de l'IRD
DataSuds est l'entrepôt institutionnel de l'IRD. Les jeux de données déposés dans DataSuds proviennent d'unités de recherche pour lesquelles l'IRD est co-tutelle, "ainsi que ses partenaires dans les pays du Sud", œuvrant en conséquence à "l'ouverture et le partage des données en particulier avec les partenaires du Suds". L'entrepôt est multidisciplinaire, et, à ce titre, accueille notamment les données des sciences humaines et sociales. Plusieurs modalités de diffusion et d'accès aux données sont possibles (accès ouvert, accès restreint). Un DOI est attribué automatiquement au jeu de données publié.

D'autres entrepôts de données généralistes sont utilisés par les communautés de recherche, à l'instar de Zenodo. Financé par la Commission Européenne, et proposé par le CERN (European Organisation for Nuclear Research) ainsi qu'OpenAire (Open Access Infrastructure for Research in Europe), Zenodo est un entrepôt généraliste et multidisciplinaire. Zenodo est à destination des communautés et projets de recherche ne disposant pas d'entrepôts institutionnels, disciplinaires ou thématiques. Plusieurs modalités de diffusion et d'accès aux données sont possibles (accès ouvert, accès restreint). Un DOI est attribué automatiquement au jeu de données publié. Zenodo met à disposition de nombreux tutoriels thématiques. 
Il est cependant important de noter que, dans le contexte français, Zenodo ne fait pas partie des entrepôts de confiance reconnus par le Collège Données de la recherche du Comité pour la science ouverte, car certains critères ne sont pas remplis. En effet, l'entrepôt ne bénéficie d'aucune modération ou validation du dépôt des jeux de données, ce qui a alors pour conséquence l'absence de normalisation de la description et de la documentation des données et métadonnées associées.

Quels sont les enjeux des identifiants persistants ? Quelles sont les spécificités des différents PID (Objet et Contributeur) utilisés dans la recherche ? Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les objectifs et recommandations concernant les identifiants pérennes, tout en détaillant les plus fréquents (DOI, ORCID, ROR, SWHID). Pour plus d'informations sur les identifiants des codes sources et des logiciels de recherche, consulter la rubrique "Codes, algorithmes, logiciels et calculs".
 

DoRANum et sa vidéo "La minute - Identifiants pérennes"
Proposée par l'Inist-CNRS, cette courte vidéo introduit en moins de 5 minutes les identifiants pérennes : définition et objectifs, types de PID (Objet et Contributeur), contexte et conditions d'attribution des PID illustrés par des exemples concrets.

DoRANum et son guide "Les identifiants pérennes : un aperçu"
L'Inist-CNRS met à disposition ce guide interactif sur les identifiants persistants, permettant de comprendre les enjeux des PID : objectifs de ces systèmes d'identification, typologie selon les PID Objet (focus DOI et SWHID) et PID Contributeur (focus ORCID et ROR), modes d'obtention. 

Comité pour la science ouverte, "Recommandations pour l’adoption des identifiants persistants dans l’enseignement supérieur et la recherche"
Pour aller plus loin, ce rapport du Collège des Données de la recherche du Comité pour la science ouverte permet de comprendre les enjeux autour de la structuration d'une stratégie nationale des PID dans l'enseignement supérieur et la recherche : "contexte et enjeux, diversité des PID, principes directeurs et objectifs stratégiques, axes opérationnels et préconisations". 

DoRANum, "Identifiants persistants (pérennes) : Quels sont les différents types d’identifiants persistants et en quoi sont-ils indispensables ?"
Pour aller plus loin, DoRANum met à disposition un vaste répertoire de ressources à explorer sur les identifiants pérennes : fiche synthétique, vidéos, guide, autoévaluation pour tester ses connaissances...

Le Digital Object Identifier (DOI) est un identifiant international, qui offre un accès pérenne aux ressources numériques (publications, jeux de données, etc) grâce à un lien unique et persistant. Il fait partie des PID Objets les plus reconnus car particulièrement utilisé dans la sphère académique. Constitué d'un code alphanumérique et associé aux métadonnées de la ressource numérique, le DOI permet de garantir l’"intégrité de la ressource et la pérennité de son accès". A ce titre, le DOI fait partie des éléments importants à intégrer pour citer les produits de la recherche tels que les jeux de données et logiciels. Pour plus d'informations sur la manière de citer les jeux de données et logiciels de recherche, consulter aussi la rubrique "Réutiliser des données".

Le texte est en partie adapté des ressources présentées ci-dessous. La citation est extraite de l'article de CoopIST "Attribuer un identifiant numérique DOI à une plateforme scientifique".
 

DoRANum et l'infographie sur le DOI "Un exemple d'attribution d'identifiant"
L'Inist-CNRS met à disposition cette infographie sur le DOI, permettant de comprendre rapidement l'importance de cet identifiant pour le chercheur.

DoRANum et son guide "Zoom sur le DOI"
L'Inist-CNRS propose ce guide, interactif et synthétique, sur le DOI : définition et objectifs, modes d'obtention, fonctionnement.

Dans la majorité des cas, lorsque les chercheurs et chercheuses déposent leurs jeux de données dans un entrepôt dédié, le DOI est automatiquement généré (gratuitement). Les organisations (institutions de recherche, éditeurs) doivent quant à elles s'acquitter d'une adhésion annuelle auprès d'une agence accréditée dans l'attribution de DOI, tel que le consortium DataCite.

Le texte est adapté des ressources présentées précédemment.
 

DataCite
Le consortium DataCite est un organisme international spécialisé dans l'attribution de DOI pour les données de recherche et autres types d'objets issus de la recherche (audiovisuel, image, carte, etc). DataCite a mis en œuvre un schéma de métadonnées (obligatoires, recommandées, facultatives) pour les objets auxquels un DOI est attribué.

CoopIST et son article "Attribuer un identifiant numérique DOI à une plateforme scientifique en 4 points"
CoopIST met à disposition cet article synthétique sur l'attribution d'un DOI, en présentant son fonctionnement ainsi qu'une liste détaillée des métadonnées associées à l'organisme spécialisé DataCite (illustré avec un exemple concret). 

PID OPIDoR
PID OPIDoR est l'un des services du portail OPIDoR mis en place par l'Inist-CNRS. En lien avec DataCite France, PID OPIDoR propose un accompagnement dans l'attribution des DOI aux données de recherche.

L'Open Researcher and Contributor ID (ORCID) est un identifiant international reconnu, constitué d'un code alphanumérique, qui identifie les chercheurs de manière unique. L'ORCID permet de "relie[r] entre eux les produits de l'activité du chercheur gérés par différents systèmes d'information". De la sorte, articles et jeux de données sont par exemple reliés de manière fiable au chercheur les ayant produits grâce à son identifiant. En plus de répondre aux problèmes de translittération et d'homonymie, avoir un ORCID permet donc de faciliter les démarches et de rassembler les productions d'un chercheur en les valorisant.

Le texte est adapté des ressources présentées ci-dessous. La citation est extraite de l'article de CoopIST "Créer un identifiant chercheur ORCID ID".

DoRANum et son guide "Zoom sur ORCID"
L'Inist-CNRS propose ce guide, interactif et synthétique, sur l'ORCID : définition et objectifs, modes d'obtention, fonctionnement.

CoopIST et sa présentation de cas pratiques dans l'article "Créer un identifiant chercheur ORCID ID"
Cet article de CoopIST expose différentes situations concrètes dans lesquelles l'ORCID peut être profitable : pour répondre à un projet ou une bourse, pour soumettre une publication ou une révision, pour déposer des jeux de données dans un entrepôt, pour marquer et retrouver les publications, ou encore pour être plus visible sur les réseaux sociaux.

ORCID US Community et l'article sur cet identifiant pour les SHS : "ORCiD and PIDs for the Humanities, Arts, & Social Sciences"
Publié sur le site de la communauté américaine d'ORCID, cet article souligne l'importance de cet identifiant pour les chercheurs en SHS. Plusieurs retours d'expérience de programmes et d’organismes permettent de détailler, grâce à ces exemples concrets, les bénéfices et intérêts que ce PID apporte aux chercheurs en SHS.

Blog de l'Institut Pasteur et son article "Les identifiants ORCID et idHAL"
Cet article du blog de l'Institut Pasteur met en avant deux identifiants, l'ORCID et l'idHAL, qui peuvent être liés et interopérables.  

L'organisation internationale à but non-lucratif ORCID est l'organisme attribuant l'identifiant ORCID ID. La démarche pour obtenir cet identifiant est personnelle, et le chercheur doit donc s'inscrire, gratuitement, sur ORCID afin de se voir attribuer en quelques étapes l'ORCID ID. L'organisme met à disposition une documentation pour vous accompagner dans la création de votre ORCID ID et découvrir les fonctionnalités associées.

ORCID et sa documentation pour créer son identifiant ORCID ID (page d'aide pour les chercheurs, FAQ, tutoriels)
ORCID propose une documentation pour accompagner, pas à pas, la création de l'ORCID ID et la découverte des différentes fonctionnalités permises grâce à cet identifiant. Une page d'aide dédiée aux chercheurs est accessible, accompagnée d'une FAQ recensant les interrogations les plus fréquentes. Des tutoriels vidéos sont également mis à disposition. 

Quels sont les enjeux des data papers ? Quels sont les critères de sélection des revues ? Quelles sont les préconisations pour rédiger ces articles singuliers ? Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les objectifs et recommandations.

DoRANum et la fiche synthétique "Data papers et data journals"
L'Inist-CNRS et l'Urfist Méditerranée mettent à disposition cette fiche synthétique sur les data papers, permettant d'introduire les enjeux, objectifs et préconisations pour la rédaction de ces publications singulières. 

CoopIST et son article "Publier un Data paper en 5 points"
CoopIST propose un article complet sur les data papers : définition, objectifs et enjeux, structure et contenu de cette publication, critères de sélection des revues publiant des data papers, critères d'évaluation des data papers, ressources complémentaires.

DoRANum, "Data papers et Data journals - Comment publier mes données comme un article scientifique ?"
Pour aller plus loin, DoRANum met à disposition un vaste répertoire de ressources à explorer sur les data papers : fiche synthétique, guide, autoévaluation pour tester ses connaissances...

Les data papers sont des articles à part entière qui, à ce titre, suivent "le même processus éditorial que les articles scientifiques". Ils comportent des spécificités propres quant à leur structure et aux éléments qui les composent.

La citation est issue du guide de DoRANum présenté ci-dessous.
 

DoRANum et son guide "Le contenu d'un data paper"
Avec la contribution d'INRAE, l'Urfist Méditerranée, propose ce guide synthétique et introductif portant spécifiquement sur le contenu des data papers : structures spécifiques aux revues, composantes communes, conditions d'accès aux données, description des données. 

Callisto et le parcours en autoformation "Rédiger et publier un Data Paper"
L'Université de Lorraine et l'Urfist de Paris ont conçu ce parcours d’autoformation complet d'environ 2h30 sur la rédaction et la publication des data papers, à destination des chercheurs, ingénieurs, doctorants et professionnels de l'information scientifique. Ce parcours permet d'appréhender les spécificités de la publication des data papers, de différencier les éléments composant ce document, de connaître les outils dédiés à leur publication, d'identifier les critères de sélection d'une revue, ainsi que de découvrir les particularités du processus de soumission d'un data paper. Cette formation est certifiante : à l'issue d'une évaluation finale permettant de valider les acquis, un open badge sera délivré.

Si votre jeu de données est déposé dans l'entrepôt national Recherche Data Gouv, il est alors possible d'utiliser l'outil de création d'ébauche de data paper proposé par l'écosystème. Cet outil génère cette proposition de data paper à partir du DOI du jeu de données. Le tutoriel de Recherche Data Gouv et les ressources complémentaires sont par exemple accessibles dans cet article.

Les data papers peuvent être publiés dans des revues spécifiquement dédiées à ce type d'article, appelées data journals (spécialisés ou multidisciplinaires). Des modèles et templates peuvent être proposés aux chercheurs pour les accompagner dans la description et la présentation de leurs données. Par ailleurs, les data papers peuvent également être publiés dans certaines revues scientifiques publiant différents types d'articles.

DoRANum et son guide "Comment trouver des data journals ?"
L'Inist-CNRS propose un court diaporama interactif sur les data journals, qui détaille notamment deux listes recensant des revues spécialisées : le site de l'Ecole polytechnique fédérale de Lausanne, ainsi que le Github du projet re3data COREF (tutoriels à disposition).

CoopIST et son recensement "Revues publiant des Data papers et des Software papers"
CoopIST propose un recensement des revues pour publier des data papers et des software papers (revues multidisciplinaires et thématiques, data journal et revue classique, publication gratuite et payante, exemples d'articles). 

Des revues spécialisées dans les humanités numériques et des data journals permettent aux chercheurs de publier des data papers sur les données de recherche en SHS. Les ressources sélectionnées présentent certaines de ces revues.
 

Data & Corpus, "la revue des données en SHS"
Éditée par l'Université de Lorraine avec le soutien de la MSH Lorraine, Data & Corpus est une revue en libre accès consacrée spécifiquement aux données en SHS. Elle publie des data papers, mais aussi des articles de méthodologie ou des articles sur des outils et logiciels portant sur l'acquisition, le traitement et la gestion des données. Cette revue œuvre à "accueillir [et mettre] en dialogue toutes les disciplines relevant des sciences humaines et sociales, avec un fort accent mis sur l'interdisciplinarité", tout en promouvant "le partage et la réutilisation des données de recherche". 

La revue Humanités numériques d'Humanistica
Éditée par l'association Humanistica en libre accès, la revue Humanités numériques "publie des travaux francophones qui explorent les transformations numériques des savoirs". Des articles de données/data papers peuvent ainsi être publiés dans cette revue dédiée aux humanités numériques. 

La revue DEMC - Données, Expériences, Méthodes et Codes
À destination des SHS, la revue en libre accès DEMC publie des articles portant spécifiquement sur l'une de ses quatre rubriques :  Données, Expériences, Méthodes et Codes. La revue cherche ainsi à valoriser le "travail reposant sur des données, des expériences, des méthodes d’exploitation ou des codes ou traitements statistiques et informatiques", afin de "rendre davantage visibles et transparents ces processus nécessaires à l’établissement des résultats de recherche".

La revue RDJ - Research Data Journal for the Humanities and Social Sciences
Research Data Journal for the Humanities and Social Sciences (RDJ) est une revue en libre accès spécialisée dans la publication de data papers, cherchant ainsi à contribuer à la transparence de la recherche, à la diffusion et à la réutilisation des données de la recherche en accord avec les principes FAIR. 

En complément de la présentation de revues spécialisées pour les SHS, ces ressources sélectionnées présentent plusieurs revues scientifiques multidisciplinaires publiant des data papers. 

La revue Peer Community Journal
Éditée par l'organisme Peer Community In (PCI), Peer Community Journal est une épirevue en libre accès publiant plusieurs types d'articles recommandés par PCI, dont des data papers.

La revue Scientific Data
Scientific Data est une revue en libre accès spécialisée sur les données de recherche, permettant de publier différents types d'articles portant sur les données (data descriptors, articles). 

Quels sont les objectifs des cahiers de laboratoire électroniques ? Quels sont les critères de sélection des outils ? Quelles sont les préconisations en matière d'utilisation ainsi que de gestion des données au sein d'un cahier de laboratoire ? Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les enjeux et recommandations de ces outils.
 

Blog de l'Institut Pasteur et l'article "Le cahier de laboratoire électronique, un outil au service de la science reproductible"
Cet article proposé dans le blog de l'Institut Pasteur souligne les enjeux et les objectifs des cahiers de laboratoires, mettant en avant leur importance en matière de collaboration et de reproductibilité. 

CNRS et le guide "Bonnes pratiques de mise en place d’un cahier de laboratoire électronique (Exemple d’eLabFTW)"
Ce guide est issu d'un travail de la Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires du CNRS (MITI). Il propose "une vision pratique sur la mise en place de ces cahiers de laboratoire électroniques en abordant les notions d’organisation préalable à l’utilisation de tels supports, les recommandations pratiques dans leur utilisation et les mesures à adopter dans la gestion des données brutes attenantes" (p.7). Privilégié par le CNRS, l'exemple du cahier de laboratoire eLabFTW permet d'illustrer un cas pratique d'utilisation de cet outil.

Comité pour la science ouverte, "Rapport du groupe de travail sur les cahiers de laboratoires électroniques"
Pour aller plus loin, le rapport du groupe de travail "Cahier de laboratoire électronique" du Comité pour la science ouverte propose "une méthodologie d'analyse aux équipes scientifiques ayant à faire le choix d'un cahier de laboratoire électronique", en soulignant l'importance de la "nécessaire interopérabilité entre [les] différents outils utilisés par les scientifiques". Ce rapport est complété par une grille de critères de choix d'un cahier de laboratoire.

Développé par Nicolas Carpi, travaillant auparavant à l’Institut Curie (Paris), le cahier de laboratoire électronique eLabFTW est un outil collaboratif et personnalisable, ayant pour objectif de "garantir la traçabilité, l’imputabilité et l’antériorité des résultats de recherche" (*). Ce logiciel sous licence libre est l'outil retenu par le CNRS depuis 2023, et est utilisé dans une centaine de ses laboratoires.

Citation extraite de la fiche de cet outil sur Cat OPIDoR. 

eLabFTW et sa documentation
eLabFTW dispose d'une documentation officielle : tutoriels, guides pratiques, définitions, ressources.

JRES 2024 et le modèle d'installation eLabFTW "Lâchez les rênes, laissez-vous guider : Installation facilitée et sécurisée d'eLabFTW"
Ce document propose "un modèle d'accompagnement sur le déploiement et la configuration de eLabFTW dans un laboratoire ou une unité de recherche". Accompagné d'une documentation complémentaire, ce modèle d'installation détaille "les étapes essentielles à suivre pour assurer une installation conforme aux exigences techniques et de sécurité en vigueur". Ce document a été conçu dans le cadre des Journées Réseau de l'Enseignement et de la Recherche (JRES 2024), par Richard Ferrere, Jean-Marc Sibaud, Henri Valeins, Sandrine Sabatié, Karine Viaud, Michel Goillandeau et Philippe Hortolland. 

Revue Katina et l'article "Can an Electronic Lab Notebook Help Researchers Do Better Science?"
Pour aller plus loin, cet article de la revue professionnelle Katina des métiers de la documentation propose un article sur les objectifs et fonctionnalités d'eLabFTW, complété par des exemples et des captures d'écran ainsi que des ressources complémentaires. Cet article pourra accompagner les laboratoires et leurs personnels dans le déploiement local de la solution eLabFTW.

Quels sont les enjeux de la visualisation des données de recherche ? En quoi permet-elle de faciliter l'accès et la compréhension des données ? Les ressources sélectionnées vous permettront d'appréhender les objectifs de la data visualisation.

DoRANum, "Accès et visualisation : fiche synthétique"
Mise à disposition par l'Inist-CNRS et l'Urfist Méditerranée, cette fiche synthétique permet d'appréhender l'importance et l'apport de la visualisation dans l'accès aux données de recherche.

DoRANum, "La visualisation des données : quelques exemples"
Ce guide proposé par l'Inist-CNRS détaille plusieurs exemples d'entrepôts ayant recours à la visualisation de données, témoignant de l'apport de cette démarche pour l'exploration et la compréhension des matériaux de recherche.  Plusieurs outils et logiciels de datavisualization sont également décrits : CorTexT, D3.js, Gargantext, Gephi, Kibana, QGIS, VOSviewer.

Wikipédia et l'article "Data and information visualization"
Pour aller plus loin, cet article Wikipédia permet de détailler les principes de la visualisation, son histoire, sa terminologie, et présente les différents types de visualisation qu'il est possible de mettre en œuvre.

A la fois langage de programmation et environnement dédié aux statistiques, le logiciel R permet de réaliser des visualisations de données personnalisées (graphiques, diagrammes, cartes etc). Les tutoriels et guides sélectionnés vous permettront de prendre en main les fonctionnalités de data visualisation permises par ce logiciel.

Les bibliothèques de l'université de Maryland et le guide "Data Visualization with R"
Mis à disposition par les bibliothèques de l'université de Maryland, ce tutoriel introductif permet d'appréhender les principales fonctionnalités et les possibilités offertes par la visualisation de données dans R.

Robert Beechman et son guide "Visualization for Social Data Science"
Le géographe Robert Beechman (Associate Professor in Geographical Analysis, University of Leeds) propose ce guide applicatif autour de la visualisation de données pour les communautés des SHS.

Robert Kabacoff et son guide "Modern Data Visualization with R"
Professeur en analyse quantitative (Quantitative Analysis Center, Wesleyan University), Robert Kabacoff propose un guide pratique pour réaliser des graphiques dans R, permettant d'identifier les graphiques les plus appropriés selon ses besoins ainsi que de les personnaliser, tout en proposant quelques préconisations en matière d'éthique.

La revue Advances in Methods and Practices in Psychological Science et l'article "Data Visualization Using R for Researchers Who Do Not Use R"
De nombreux autres tutoriels sur la visualisation de données dans R existent, s'adressant à différents publics selon leurs niveaux d'expertise, à l'instar de ce tutoriel destiné plus particulièrement aux néophytes de R (Nordmann Emily et al., Advances in Methods and Practices in Psychological Science, 2022).

Omeka est un logiciel open source de gestion de bibliothèque numérique, "dédié à l'organisation, l'exposition, à la mise en ligne de données iconographiques, avec leurs métadonnées, qui permet d'en faire très facilement une publication sur le Web" (*). L'une de ses versions, Omeka S, permet d'héberger et de gérer plusieurs sites Web via une interface unique de gestion.

Le texte est adapté du chapitre sur Omeka S dans l'article Wikipédia portant sur Omeka.

(*) Citation extraite du chapitre suivant : Boulaire, Cécile, et Romeo Carabelli. « Chapitre 7. Du digital naive au bricoleur numérique : les images et le logiciel Omeka ». In Expérimenter les humanités numériques, édité par Étienne Cavalié, Frédéric Clavert, Olivier Legendre, et Dana Martin. Montréal: Presses de l’Université de Montréal, 2017, doi.org/10.4000/books.pum.11115.

Callisto et le parcours en autoformation "Préparer, traiter et enrichir une bibliothèque numérique avec Omeka S"
Maximilien Petit (Université Versailles-Saint-Quentin-en-Yvelines) a conçu ce parcours d'autoformation complet d'environ 4 heures sur Omeka S. Ce parcours permet d'appréhender les fonctionnalités documentaires d'Omeka S, de savoir gérer une base de données documentaires, d'importer et d'organiser des collections de documents, d'enrichir et de contrôler la qualité des données, de créer et d'administrer un site web documentaire, ainsi que de valoriser les collections numériques (*). Cette formation est certifiante : à l'issue d'une évaluation finale permettant de valider les acquis, un open badge sera délivré.

(*) Ces objectifs sont issus de la fiche descriptive du parcours d'autoformation sur Callisto.

Omeka S et son manuel utilisateur
Ce manuel d'utilisation d'Omeka S détaille les différentes étapes nécessaires pour l'utilisation de cet outil et ses multiples fonctionnalités.

GarganText est un logiciel libre combinant "des outils de traitement du langage naturel, de text-mining, d’apprentissage machine, d’analyse de réseaux complexes et de visualisation interactive de données pour ouvrir la voie à de nouveaux types d’interactions avec les masses de données textuelles"(*). A ce titre, des cartes interactives peuvent être produites afin de lier des concepts scientifiques lors de l'exploration d'un corpus documentaire.

Le texte est adapté de la description de GarganText sur la page "Explorer mes données de recherche" du CNRS. 
(*) Citation extraite de la fiche descriptive du logiciel dans Cat OPIDoR. 
 

GarganText et le tutoriel "Make your first map in 10 min" 
GarganText propose ce court tutoriel introductif pour prendre en main le logiciel, en créant une carte en quelques minutes. Un second tutoriel est disponible en fin de page pour apprendre à l'améliorer. 

GarganText et sa documentation
GarganText dispose d'une documentation officielle : tutoriels, guides pratiques, références techniques.

Mate-SHS et le webinaire Tut@MATE "GarganText: la cartographie des connaissances pour tous"
Pour aller plus loin, Alexandre Delanoë, ingénieur de recherche à l'Institut des systèmes complexes (CNRS) et chef de projet de la plateforme GarganText, propose une présentation de ce logiciel lors d'un webinaire de 2 heures dans le cadre des Tuto@MATE du réseau Mate-SHS.

Khartis est un outil libre de cartographie, développé par l'Atelier de cartographie de Sciences Po. Il permet de créer des cartes thématiques en quelques étapes. Quatre visualisations cartographiques initiales sont proposées : "des points proportionnels et des classes de valeurs/couleurs pour représenter des quantités et des formes/couleurs/tailles différentes dans le cas de catégories à distinguer, sur des coordonnées précises (points) ou des territoires (surfaces)".

Mate-SHS et Sciences Po, "Khartis, outil de cartographie thématique libre"
Pour aller plus loin, Patrice Mitrano (Atelier de cartographie de Sciences Po), propose une présentation de ce logiciel lors d'un webinaire de 2 heures dans le cadre des Tuto@MATE du réseau Mate-SHS.